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Pandas DataFrame按组填充缺失日期行与数据插补指南

霞舞

霞舞

发布时间:2025-09-26 16:15:01

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来源于php中文网

原创

Pandas DataFrame按组填充缺失日期行与数据插补指南

本教程详细介绍了如何在Pandas DataFrame中,针对按指定键分组的数据,高效地填充缺失的日期行。通过结合groupby、date_range和reindex,并配合前后向填充及默认值填充策略,确保时间序列数据的完整性,为后续分析提供规整的数据集。

问题场景:分组时间序列数据缺失

在数据分析实践中,我们经常会遇到时间序列数据不连续的情况,尤其是在数据按某个类别(如产品id、客户键等)分组时。例如,一个dataframe可能包含日期、分组键和对应的数值,但某些日期在特定分组下可能没有记录,导致数据稀疏。

考虑以下原始DataFrame df:

import pandas as pd

data = {
    'date': ['2023-12-01', '2023-12-03', '2023-12-04', '2023-12-01'],
    'key': ['K0', 'K1', 'K0', 'K1'],
    'value': [9, 3, 10, 8]
}
df = pd.DataFrame(data)
df['date'] = pd.to_datetime(df['date'])

print("原始DataFrame:")
print(df)

输出:

原始DataFrame:
        date key  value
0 2023-12-01  K0      9
1 2023-12-03  K1      3
2 2023-12-04  K0     10
3 2023-12-01  K1      8

可以看到,对于key为K0和K1的组,2023-12-02和2023-12-03(对K0)以及2023-12-02和2023-12-04(对K1)等日期缺失。我们的目标是为每个key组填充所有缺失的日期行,并为新生成的行中的value列赋予一个默认值(例如0),同时保持key列的正确性。

核心方法:groupby与reindex结合

解决这类问题的核心思路是:首先确定一个完整的日期范围,然后针对每个分组,将其时间序列数据与这个完整日期范围进行对齐(reindex),最后对新生成的缺失值进行填充。

步骤一:确定全局日期范围

为了确保所有分组都拥有一个统一的、完整的日期序列,我们首先需要从原始DataFrame中找出最早和最晚的日期。

mx, mn = df["date"].max(), df["date"].min()
print(f"全局最小日期: {mn}, 全局最大日期: {mx}")

步骤二:定义分组处理函数

我们将创建一个辅助函数,该函数将应用于groupby操作的每个子DataFrame(即每个分组)。

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def fill_missing_dates_for_group(group_df, global_max_date, global_min_date):
    """
    为单个分组DataFrame填充缺失日期行并进行数据插补。

    参数:
    group_df (pd.DataFrame): 当前分组的DataFrame。
    global_max_date (pd.Timestamp): 整个数据集的最大日期。
    global_min_date (pd.Timestamp): 整个数据集的最小日期。

    返回:
    pd.DataFrame: 填充并插补后的分组DataFrame。
    """
    # 确保日期列为datetime类型
    group_df["date"] = pd.to_datetime(group_df["date"])

    # 生成一个从全局最小日期到最大日期的完整日期范围
    full_date_range = pd.date_range(global_min_date, global_max_date)

    # 设置日期列为索引,然后使用完整日期范围进行reindex
    # reindex操作会在缺失日期处引入NaN行
    reindexed_df = group_df.set_index("date").reindex(full_date_range).reset_index()

    # reindex后,原有的日期列现在是新的索引,reset_index将其变为名为'index'的列
    # 我们将其重命名回'date'以保持一致性
    reindexed_df = reindexed_df.rename(columns={'index': 'date'})

    # 填充'key'列:由于reindex引入的NaN行,其'key'列会是NaN。
    # 使用ffill()(向前填充)和bfill()(向后填充)组合,确保所有新行都有正确的'key'。
    # ffill()会填充组内之前的值,bfill()会填充组内之后的值,处理边界情况。
    reindexed_df["key"] = reindexed_df["key"].ffill().bfill()

    # 填充'value'列:将reindex引入的NaN值填充为0,并转换为整数类型。
    reindexed_df["value"] = reindexed_df["value"].fillna(0).astype(int)

    return reindexed_df

步骤三:应用函数到每个分组

最后,我们将使用groupby().apply()方法将上述函数应用到DataFrame的每个key分组。group_keys=False参数可以防止groupby在结果中添加额外的分组键索引层。

output_df = df.groupby("key", group_keys=False).apply(
    fill_missing_dates_for_group,
    global_max_date=mx,
    global_min_date=mn
)

print("\n填充缺失日期后的DataFrame:")
print(output_df)

输出:

填充缺失日期后的DataFrame:
        date key  value
0 2023-12-01  K0      9
1 2023-12-02  K0      0
2 2023-12-03  K0      0
3 2023-12-04  K0     10
0 2023-12-01  K1      8
1 2023-12-02  K1      0
2 2023-12-03  K1      3
3 2023-12-04  K1      0

可以看到,每个key组现在都包含了从2023-12-01到2023-12-04的完整日期序列,并且缺失的value值已被填充为0。

完整示例代码

以下是整个过程的完整代码示例:

import pandas as pd

# 1. 原始数据准备
data = {
    'date': ['2023-12-01', '2023-12-03', '2023-12-04', '2023-12-01'],
    'key': ['K0', 'K1', 'K0', 'K1'],
    'value': [9, 3, 10, 8]
}
df = pd.DataFrame(data)
df['date'] = pd.to_datetime(df['date'])

print("--- 原始DataFrame ---")
print(df)
print("-" * 30)

# 2. 确定全局日期范围
global_max_date, global_min_date = df["date"].max(), df["date"].min()

# 3. 定义分组处理函数
def fill_missing_dates_for_group(group_df, global_max_date, global_min_date):
    """
    为单个分组DataFrame填充缺失日期行并进行数据插补。
    """
    group_df["date"] = pd.to_datetime(group_df["date"])
    full_date_range = pd.date_range(global_min_date, global_max_date)

    reindexed_df = group_df.set_index("date").reindex(full_date_range).reset_index()
    reindexed_df = reindexed_df.rename(columns={'index': 'date'})

    reindexed_df["key"] = reindexed_df["key"].ffill().bfill()
    reindexed_df["value"] = reindexed_df["value"].fillna(0).astype(int)

    return reindexed_df

# 4. 应用函数到每个分组
output_df = df.groupby("key", group_keys=False).apply(
    fill_missing_dates_for_group,
    global_max_date=global_max_date,
    global_min_date=global_min_date
)

print("\n--- 填充缺失日期后的DataFrame ---")
print(output_df)
print("-" * 30)

注意事项与优化

  1. 日期范围的灵活性:
    • 本教程中使用的是全局最小和最大日期。在某些情况下,您可能希望每个分组有其自身的日期范围,或者是一个固定的、预设的日期范围。
    • 如果每个组的日期范围不同,可以在fill_missing_dates_for_group函数内部计算group_df["date"].max()和group_df["date"].min()来确定当前组的范围。
  2. 填充策略的多样性:
    • fillna(0) 是一种常见的填充策略,适用于表示“无活动”或“零值”的场景。
    • 根据业务需求,value列的缺失值可以采用其他插补方法,例如:
      • fillna(method='ffill'):向前填充,使用前一个有效值。
      • fillna(method='bfill'):向后填充,使用后一个有效值。
      • interpolate(method='linear'):线性插值。
      • fillna(group_df['value'].mean()):使用该组的平均值填充。
  3. 性能考量:
    • 对于非常大的数据集(例如,数百万行,成千上万个分组),groupby().apply()可能不是最高效的方法,因为它本质上是一个循环操作。
    • 可以考虑其他替代方案,例如:
      • 使用pd.MultiIndex.from_product创建所有可能的key-date组合,然后与原始DataFrame进行merge操作,最后再进行fillna。这种方法通常对大型数据集更具向量化优势。
      • 例如:full_index = pd.MultiIndex.from_product([df['key'].unique(), pd.date_range(mn, mx)], names=['key', 'date'])result = df.set_index(['key', 'date']).reindex(full_index).reset_index()result['value'] = result['value'].fillna(0).astype(int)
  4. 多重分组键:
    • 如果需要按多个键进行分组(例如,key1和key2),只需将groupby("key", ...)更改为groupby(["key1", "key2"], ...)即可。函数fill_missing_dates_for_group内部的key填充逻辑也需要相应调整,或者确保在reindex后,所有分组键都被正确地ffill().bfill()。

总结

通过结合Pandas的groupby()、date_range()和reindex()功能,我们可以有效地处理分组时间序列数据中的日期缺失问题。这种方法不仅能够填充缺失的日期行,还能灵活地对新增行的其他列进行插补,从而生成一个完整、规整的数据集,为后续的数据分析和建模奠定坚实基础。在实际应用中,根据数据规模和业务需求,可以选择最适合的填充策略和性能优化方案。

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