CML是一种基于XML的化学信息标记语言，通过等专用标签精确描述分子结构、反应及光谱数据，支持语义校验、嵌套扩展与多格式无损转换。
CML（Chemical Markup Language）是一种专为化学信息设计的XML格式，它用标准的XML语法来精确描述分子结构、化学反应、光谱数据等，让计算机能自动识别、交换和处理化学内容。
为什么用XML来表达化学信息
XML本身不规定具体含义，只提供结构化框架。CML在此基础上定义了一套化学专用标签，比如
- 所有原子坐标、键级、电荷、立体化学信息都能用属性或子元素表达
- 支持嵌套结构，例如一个reaction>内可包含多个
作为反应物或产物 - 可通过XML Schema（XSD）校验文件合法性，避免人为格式错误
CML文件长什么样
一个最简水分子CML片段类似这样：
它比SMILES更直观，比MOL文件更易解析，也比纯文本描述更具机器友好性。
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本文档是python学习笔记与简明教程；为什么用Python作为编程入门语言？每种语言都会有它的支持者和反对者。去Google一下“why python”，你会得到很多结果，诸如应用范围广泛、开源、社区活跃、丰富的库、跨平台等等等等，也可能找到不少对它的批评，格式死板、效率低、国内用的人很少之类。不过这些优缺点的权衡都是程序员们的烦恼。作为一个想要学点编程入门的初学者来说，简单才是最重要的。当学C++的同学还在写链表，学Java的同学还在折腾运行环境的时候，学Pyt
CML和其他化学格式的关系
CML不是替代格式，而是整合枢纽：
- 几乎所有常见格式（MOL、SDF、PDB、XYZ、CIF）都可无损转换为CML
- 支持增量扩展：用户可自定义
添加实验条件、计算方法、作者信息等元数据 - 被JChem、Avogadro、Jmol、Open Babel等主流工具原生支持，也常用于化学数据库（如Crystallography Open Database）的数据导出
实际使用时要注意什么
CML强调语义正确性，不是“能跑就行”：
- 必须严格闭合标签，属性值加引号，符合XML基础语法
- 推荐用CML Schema（cml.xsd）校验，避免遗漏必需字段（如elementType不能为空）
- 大分子或晶体结构建议分块组织，用
包裹多个 ，提升可读性和加载效率
