发票查询系统不支持作废，须通过电子税务局、代开作废模块、自助终端、开票软件或发票缴销功能处理；各途径均要求当月未抄税/未缴款等条件，作废后查询系统状态同步更新为已作废或已缴销。
如果您在发票查询系统中查到某张已开具的发票需要终止其效力，则需注意：发票查询系统本身不提供作废功能，作废操作必须在开票系统、电子税务局或自助终端等具备权限的业务系统中执行。以下是可行的作废途径：
一、通过电子税务局作废纸质发票
电子税务局支持对当月开具且未抄税、未记账的纸质发票进行作废处理，系统会同步更新发票状态并在查询系统中体现“已作废”标识。
1、登录电子税务局，点击【我要办税】—【开票业务】—【纸质发票业务】—【纸质发票作废】。
2、进入页面后选择“填开作废”页签，系统自动加载当前可作废的纸质发票列表。
3、勾选需作废的发票记录，点击【批量作废】；或在操作列单独点击【作废】按钮。
4、系统弹出确认提示，点击【确定】完成作废，作废后的发票在发票查询系统中状态变更为已作废。
二、通过代开发票作废模块处理代开票
针对税务机关代开的增值税发票，若符合当月作废条件（即代开当月、未缴款、发票原件齐全），可在电子税务局提交作废申请，审批通过后状态实时同步至查询系统。
1、登录新电子税局，点击【我要办税】—【发票业务】—【代开作废】。
2、系统自动带出最近代开的发票信息，也可通过搜索框输入发票代码、号码或开票日期进行筛选。
3、选择目标发票，点击【作废】进入申请页面。
4、核对发票信息，如该发票已缴款，须必填作废原因；确认无误后点击【提交】。
5、系统提示“作废申请已提交”，待审核通过后，发票查询系统中该票状态更新为已作废。
三、通过跨平台自助终端作废税控发票
适用于已部署税控设备的自助终端，支持现场身份认证后直接发起作废流程，作废结果即时回传至税务核心系统，查询系统可实时反映最新状态。
1、在自助终端主界面选择“发票作废(税控)”功能。
2、按提示完成操作员身份认证（如刷身份证或输入工号密码）。
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3、输入需作废发票的发票代码、号码及校验码，点击【下一步】。
4、核对发票信息，确认无误后点击【作废】按钮。
5、进入审核环节，由审核员刷身份证或输入审核账号密码完成二次认证；认证通过后系统立即执行作废操作，并在查询系统中将该发票标记为已作废。
四、通过开票软件作废本地开具的纸质普通发票
适用于使用增值税发票开票软件（如税务UKey版、金税盘、税控盘）开具的纸质普通发票，仅限开票当月且未抄报税前操作，作废后数据电文与纸质票面同步标记。
1、打开开票软件，进入【发票管理】—【发票作废】模块。
2、选择对应发票种类，输入发票代码和号码，点击【查询】定位目标发票。
3、勾选查询结果中的发票，点击【作废】按钮。
4、系统弹出二次确认窗口，点击【确认】后，该发票在开票系统中状态变为作废，同时在发票查询系统中显示为已作废。
五、通过发票缴销功能处理已丢失或损毁的纸质发票
当发票实物已无法收回（如丢失、损毁），但需终止其法律效力时，可通过“发票缴销”流程实现等效作废，税务机关审核后在系统中标记为缴销，查询系统中状态更新为已缴销（视同作废）。
1、登录电子税务局，点击【我要办税】—【发票业务】—【发票缴销】。
2、系统列出当前可缴销的纸质发票明细，勾选目标发票。
3、根据提示上传情况说明及佐证材料（如登报声明、派出所证明等）。
4、选择缴销类型为“损毁”或“丢失”，填写缴销原因说明，点击【提交】。
5、系统生成缴销申请表，确认无误后点击【申请缴销】；税务机关审核通过后，该发票在查询系统中状态更新为已缴销（视同作废）。
