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C# 操作DICOM SR文件 C#如何解析医疗影像的结构化报告

幻夢星雲

幻夢星雲

发布时间:2026-02-13 08:13:45

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来源于php中文网

原创

dicomdataset.read 读 sr 报“unsupported transfer syntax”因未注册对应解码器,需调用 dicomencoding.registerencoding 注册 deflatedexplicitvrlittleendian 等;sr 内容项需递归遍历 root.contentsequence 获取;测量值须解析 measuredvaluesequence 中的 numericvalue 和 measurementunitscodesequence;生成 sr 时须正确设置模板 id、specificcharacterset 及编码一致性。

c# 操作dicom sr文件 c#如何解析医疗影像的结构化报告

DicomDataset.Read 读取 SR 文件时为什么报“Unsupported transfer syntax”

DICOM SR(Structured Report)不是普通图像,它依赖特定传输语法(Transfer Syntax),比如 1.2.840.10008.1.2.1(Explicit VR Little Endian)或 1.2.840.10008.1.2.1.99(Deflated Explicit VR Little Endian)。直接用 DicomDataset.Read 读原始文件,若未启用对应解码器,就会抛出这个错误。

解决方法很简单:在读取前注册解码器。常见漏掉的是 Deflate 解压支持——很多 SR 文件被压缩过。

  • 调用 DicomEncoding.RegisterEncoding(DicomTransferSyntax.DeflatedExplicitVRLittleEndian),再读
  • 如果仍失败,检查文件头前 128 字节是否有 DICOM 导言(DICM),没有的话可能是纯 XML 或封装格式(如 ZIP),得先解包
  • 别用 File.ReadAllBytes + DicomDataset.Read 硬读,优先用 DicomFile.Open,它自动处理导言和传输语法协商

DicomStructuredReport 解析后拿不到内容项(Content Items)

SR 的核心是树状的 ContentSequence,但 DicomStructuredReport 构造后默认不展开嵌套结构——它只加载顶层数据集,深层内容项需手动遍历 Root.ContentSequence

容易误以为“解析成功了但内容为空”,其实是没往下钻。

  • 不要只看 Root.CodeValueRoot.RelationshipType,这些只是根节点元信息
  • 用递归方式遍历 ContentSequence,每个项是 DicomContentItem,其 ValueType 决定怎么取值(如 CODECodeValueTEXTTextValue
  • 注意 ContentSequence 可能为空,但子节点藏在 ContentTemplateSequence 里(尤其 IOD 模板化报告),得查 TemplateIdentifier

从 SR 提取测量值时,MeasuredValueSequence 里的数值单位对不上

DICOM SR 中的测量值(如病灶长径、CT 值)都封装在 MeasuredValueSequence,但它不直接存数字,而是存 NumericValueDS 类型)、MeasurementUnitsCodeSequence(单位编码)两部分。单位不是字符串,是标准 SNOMED CT 或 UCUM 编码。

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直接 ToString() 会丢单位,硬转 double 可能因小数位数丢失精度。

  • NumericValuestring,要用 decimal.TryParse 而非 double.Parse,避免浮点误差(DICOM 要求 DS 保留原始精度)
  • 单位编码查 CodeValue + CodingSchemeDesignator,例如 CodeValue="258680004" + CodingSchemeDesignator="SCT" 对应 “millimeter”
  • 别忽略 MeasurementAccuracyMeasurementMethodCodeSequence,临床系统常靠它们判断可信度

用 fo-dicom 生成 SR 时,写入后 PACS 拒收或显示乱码

生成合法 SR 不只是填字段,必须满足 IOD(Information Object Definition)约束:模板 ID、必需属性、关系路径、编码一致性。PACS 拒收往往卡在 ContentTemplateSequence 缺失或 TemplateIdentifier 错误。

中文文本乱码多因字符集声明不匹配——DICOM 默认 ISO_IR 192(UTF-8),但有些旧 PACS 仍期望 ISO_IR 100(Latin-1)。

  • 新建 DicomStructuredReport 时显式指定 SpecificCharacterSet = "ISO_IR 192"
  • 所有文本字段(TextValuePersonName)必须 UTF-8 编码,且 DicomDatasetSpecificCharacterSet 属性要同步设置
  • 模板 ID 必须来自 DICOM 标准(如 TID 1500 “Imaging Measurement Report”),自定义 ID 需在 MappingResource 中声明,否则 PACS 当非法
  • 写入前用 DicomFile.Save 保存为文件,再用 dcmtkdcmdump 检查 (0040,0005) Content Template Identifier 是否存在且格式正确

SR 的结构比表面看起来深得多,一个 ContentItemRelationshipTypeCONTAINS 还是 HAS OBS CONTEXT,直接影响下游系统如何渲染和索引。别只盯着值,关系链才是关键。

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