linux sort多字段排序详解

小云云

发布时间：2018-02-11 10:43:34

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原创

linux多数发行版自带的sort程序，非常强大，在此只说多字段排序，sort 有个参数-k，可以指定字段，有比较复杂的语法，不在文本范围内。本文主要和大家介绍了linux sort多字段排序实例解析，分享了相关代码示例，小编觉得还是挺不错的，具有一定借鉴价值，需要的朋友可以参考下，希望能帮助到大家。

一下为一段数据（从基因中得到，仅仅作为demo）,文件名为 data

chr13 3008566 3008677chr9 3024384 3024515chr19 3157071 3157172chr5 3236386 3236476chr13 3041044 3041191chr12 3045343 3045532chr6 3087308 3087625chr5 3109870 3110091chr9 3115454 3115531

字段中间以空格分开

现在想首先按照染色体进行排序，然后相同的染色体上的基因按起始位点进行排序，那么这就是一个多字段的排序，而且第二个字段为数字，使用sort命令如下

sort -t ' ' -k1,1 -k2n,2 data

其中 -t ' ' 指定使用空格分列

-k1,1 指定以第一列为关键字排序
-k2n,2 指定以第二列为关键字做数据排序

也可以使用

sort +0 -1 +1n -2

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效果是一样的。

排序结果

chr12 3045343 3045532
chr13 3008566 3008677
chr13 3041044 3041191
chr19 3157071 3157172
chr5 3109870 3110091
chr5 3236386 3236476
chr6 3087308 3087625
chr9 3024384 3024515
chr9 3115454 3115531

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