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强烈推荐Windows平台下生信环境搭配:Windows Terminal + WSL

看不見的法師

看不見的法師

发布时间:2025-07-05 08:20:25

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来源于php中文网

原创

强烈推荐windows平台下生信环境搭配:windows terminal + wsl我之前的文章中提到过,对于生信工作者来说,理想的工作设备是mac电脑+linux服务器,但有些同学仍在使用windows平台,或者公司只提供了windows电脑(这是常见的情况)。

在这种情况下,传统的做法是先安装一个虚拟机,比如广为人知的VMware,然后在虚拟机中安装Linux系统。这种方法有一个很大的缺点,就是虚拟机会占用大量的计算机硬件资源,并且启动也需要一定的时间,操作起来不太方便。

有没有更好的替代方案呢?答案是肯定的,并且我强烈推荐使用:Windows Terminal + WSL

WSL,即Windows Subsystem for Linux的缩写,意思是Windows内置的Linux子系统,无需虚拟机,直接在Windows下提供Linux运行环境,能够支持大多数命令行工具、程序和应用,这对我们来说非常有用。

举个例子:

学习Linux。WSL提供了常用的Linux命令支持,如ls、cd、cat、less、tar,以及文本处理的三驾马车sed、grep、awk,新手完全可以在WSL下入门Linux。学习脚本语言。可以在WSL下学习Python、Perl等脚本语言。为远程工作提供终端。Windows的终端工具Windows Terminal非常强大,由于安装了WSL获得了Linux支持,我们可以在终端下通过Linux命令ssh完成远程登录,以及通过scp命令完成本地与远程服务器之间的文件传输,这通常就足够了。因为我们的日常工作流程通常是这样的:

1、登录服务器(使用ssh命令),查看有什么工作需要处理;

2、如果本地有文件需要传到服务器,则使用scp命令;

3、在服务器上完成数据分析,运用各种命令、软件、分析流程等,必要时编写一些脚本协助处理;

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下载

4、分析结果打包,使用tar命令;

5、打包结果传回本地电脑,仍然使用scp命令;

6、将结果发送给客户或其他同事。

整个流程都可以在Windows Terminal中完成,不再需要传统的xshell,SecureCRT,以及Filezilla等软件。

因此,Windows Terminal + WSL,实在是Windows平台下生信人学习和办公的首选。

至于安装,网上很容易找到相关资料,有兴趣的可以尝试一下。


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